浙大病理AI助手,,3秒鎖定癌癥病灶
惡性腫瘤作為一種復(fù)雜且兇險(xiǎn)的疾病,近年來呈現(xiàn)出年輕化、發(fā)病率上升的態(tài)勢,,是威脅人類健康的“頭號殺手”。隨著國家醫(yī)療水平的提升和居民健康意識的增強(qiáng),癌癥的篩查和診斷逐漸受到重視,,隨之而來的是病理科等科室醫(yī)生日益飽和的工作量和驟升的診斷壓力。
面向臨床病理診斷的真需求,,從2020年起,,浙江大學(xué)計(jì)算機(jī)學(xué)院宋明黎教授團(tuán)隊(duì)聯(lián)合浙江大學(xué)附屬第一醫(yī)院章京教授團(tuán)隊(duì),依托豐富的數(shù)據(jù)和算力資源,,組建起一支計(jì)算機(jī)+醫(yī)學(xué)的學(xué)科交叉團(tuán)隊(duì),,致力于用AI技術(shù)賦能臨床精準(zhǔn)診斷,提高醫(yī)生工作效率和醫(yī)療質(zhì)量,。
近日,,團(tuán)隊(duì)發(fā)布視覺與語言模型融合的AI病理助手——OmniPT。該病理助手已在浙大一院病理科多個(gè)高發(fā)病率癌癥開展臨床驗(yàn)證,,1-3秒內(nèi)就能鎖定病理圖中癌癥病灶,。
今天,讓我們一起走進(jìn)他們的故事,,了解他們?nèi)绾螢榘┌Y診斷裝上智能“大腦”,。
讓機(jī)器“聽懂”醫(yī)生的話
對于計(jì)算機(jī)背景的宋明黎團(tuán)隊(duì)來說,學(xué)習(xí)基礎(chǔ)的醫(yī)學(xué)知識,、理解病理學(xué)的復(fù)雜性和多樣性是開展交叉研究的第一大挑戰(zhàn),。
“與普通X光或CT的讀片相比,病理診斷的難度在于依據(jù)復(fù)雜多樣的關(guān)鍵組織結(jié)構(gòu)進(jìn)行精準(zhǔn)定性及定量分析,。”浙大一院病理科副主任醫(yī)師張秀明介紹,,癌癥組織的單個(gè)切片雖然只有指甲蓋大小,但多切片的掃描圖像有著驚人的尺寸——數(shù)10億像素,,是手機(jī)照片的數(shù)千倍,。
上億個(gè)細(xì)胞圖像背后隱藏著無數(shù)的生命信息和醫(yī)學(xué)奧秘。醫(yī)生在分析病理切片時(shí),,需要耗費(fèi)大量時(shí)間觀察微觀細(xì)節(jié),,在長期讀片的工作中,,容易出現(xiàn)視覺疲勞。而且早期癌癥的病變細(xì)胞數(shù)量少,,漏診也是醫(yī)生們最為擔(dān)心的問題之一,。
AI助手的加入,無疑為病理科醫(yī)生和病人們來了新的希望,。宋明黎團(tuán)隊(duì)研讀大量的醫(yī)學(xué)文獻(xiàn),,與章京團(tuán)隊(duì)長期深入交流,逐漸構(gòu)建起病理學(xué)的知識框架,。
然而,,如何將人類的知識理念轉(zhuǎn)化為機(jī)器能夠“聽”得懂的語言?
團(tuán)隊(duì)成員們歸納癌癥病理結(jié)構(gòu)的形態(tài)特征,,在圖像上進(jìn)行精細(xì)的標(biāo)注和分類,,反復(fù)打磨細(xì)胞檢測、組織分割等算法工具,,磨合人-機(jī)的溝通方式,,4年間,從無到有建立起多個(gè)癌癥病種的診斷分析專用模型,,OmniPT就此誕生,。
為了提高推理效率,OmniPT在處理超大尺寸病理圖像時(shí)采用了一種跨層級的快速鎖定技術(shù):先抓取大范圍的可疑區(qū)域,,再對這些可疑部分逐級放大,,分析細(xì)節(jié)。
軟件學(xué)院副教授馮尊磊說,,這種“抓重點(diǎn)”的讀圖模式模仿了病理科醫(yī)生在臨床診斷時(shí)的思路,,實(shí)現(xiàn)病理智能診斷分析效率的大幅提升。人工耗時(shí)至少10多分鐘分析的圖像,,OmniPT只需要1-3秒就能快速鎖定病灶區(qū)域,。
經(jīng)過無數(shù)次的嘗試和優(yōu)化,OmniPT突破了超大尺寸病理圖秒級推理,、精準(zhǔn)分析的難題,,在胃癌、結(jié)直腸癌和宮頸癌等十余個(gè)高發(fā)病率癌種上取得了95%以上診斷準(zhǔn)確性,,為病理科醫(yī)生帶來了強(qiáng)大的助力,,也為患者爭取到了更快、更準(zhǔn)的診斷結(jié)果,。
人機(jī)交互,,助力科研
“OmniPT的設(shè)計(jì)也充分考慮了醫(yī)生的使用習(xí)慣和需求,融入了文本和視覺的強(qiáng)對齊功能。”馮尊磊說,,這使它更像是一位懂得“察言觀色”的智能伙伴。
醫(yī)生可以通過輸入文本或框選圖像的方式,,快速標(biāo)注出需要重點(diǎn)關(guān)注的區(qū)域,,跨層級的高效特征鎖定技術(shù)為醫(yī)生和OmniPT之間搭建了一座溝通的橋梁,實(shí)現(xiàn)了真正的人機(jī)“交流”,。醫(yī)生可以隨心所欲地引導(dǎo)OmniPT,,讓它聚焦于自己關(guān)心的每一個(gè)細(xì)節(jié),使讀片診斷變得更加智能,、更具針對性,。
腫瘤標(biāo)志物作為癌癥診斷和治療監(jiān)測的重要生物指標(biāo),其表達(dá)水平與腫瘤的生物學(xué)行為及臨床預(yù)后具有相關(guān)性,,可為個(gè)體化治療方案的選擇提供重要參考依據(jù),。OmniPT通過其高性能計(jì)算分析能力,對細(xì)胞形態(tài)學(xué)特征和組織結(jié)構(gòu)特征進(jìn)行定量解析,,從大規(guī)模高分辨率病理圖中成功識別出多個(gè)具有潛在臨床應(yīng)用價(jià)值的新型腫瘤標(biāo)志物,。“這些標(biāo)志物在腫瘤的早期診斷、分型及預(yù)后評估中具有重要價(jià)值,。”張秀明說,。
此外,OmniPT還揭示了這些標(biāo)志物與腫瘤發(fā)生,、發(fā)展之間的潛在關(guān)聯(lián),,為腫瘤的診斷、治療和藥物設(shè)計(jì)提供了新的思路和方法,,為未來的科研工作奠定了堅(jiān)實(shí)的基礎(chǔ),。
構(gòu)建智能化病理生態(tài)
“我們的這項(xiàng)工作將助力推動臨床診療指南的更新,為指南的制定提供更加科學(xué),、系統(tǒng)的依據(jù),。”馮尊磊說,這有助于提高診療的規(guī)范性和有效性,,為患者帶來更好的治療效果,。
AI醫(yī)生是否會取代人類醫(yī)生?
面對這一備受關(guān)注的問題,,團(tuán)隊(duì)成員們給出了答案:不會,。OmniPT的定位非常清晰,在醫(yī)療診斷中它只是醫(yī)生的助手,。“醫(yī)學(xué)是一門復(fù)雜的學(xué)科,,醫(yī)生是診斷的責(zé)任主體,數(shù)據(jù)和算法固然重要,,但最終還是需要回歸到醫(yī)生的經(jīng)驗(yàn)和判斷,。”章京說,。
對于未來,宋明黎團(tuán)隊(duì)有著更加長遠(yuǎn)的規(guī)劃和愿景,。依托于工信部和國家藥監(jiān)局聯(lián)合審批的數(shù)字病理人工智能醫(yī)療器械臨床試驗(yàn)中心,,他們希望通過OmniPT的臨床應(yīng)用和底層數(shù)字病理掃描設(shè)備的結(jié)合,深度推動病理科的高效,、精準(zhǔn)診斷分析,。同時(shí),他們還計(jì)劃將OmniPT拓展到更多癌種及非腫瘤疾病中,,構(gòu)建一個(gè)智能化的病理生態(tài),。
“我們的目標(biāo)是構(gòu)建一個(gè)智能化的病理生態(tài)。”宋明黎說,,“在這個(gè)生態(tài)中,,AI技術(shù)將與醫(yī)學(xué)知識深度融合,為醫(yī)生提供更加便捷,、高效的輔助工具,。同時(shí),我們也希望這個(gè)生態(tài)能夠推動醫(yī)學(xué)的進(jìn)步和發(fā)展,,為患者帶來更好的治療效果和生活質(zhì)量,。”
從組建團(tuán)隊(duì)到研發(fā)OmniPT
從拓展應(yīng)用領(lǐng)域
到構(gòu)建智能化病理生態(tài)
宋明黎團(tuán)隊(duì)用他們的智慧和汗水
書寫了一段傳奇
他們不僅為癌癥診斷
裝上了智能“大腦”
更為醫(yī)學(xué)的進(jìn)步和發(fā)展
注入了新的活力
來源:浙江大學(xué)官微